AT3G21150.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : B-box 32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with a B-box domain predicted to act as a transcription factor. Expression of the BBX32 gene is affected by monochromatic red light. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
B-box 32 (BBX32); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: B-box type zinc finger family protein (TAIR:AT4G15248.1); Has 926 Blast hits to 858 proteins in 65 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 926; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7412713..7413390 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24717.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 225 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSFCELCGA EADLHCAADS AFLCRSCDAK FHASNFLFAR HFRRVICPNC KSLTQNFVSG PLLPWPPRTT CCSESSSSSC CSSLDCVSSS ELSSTTRDVN 101: RARGRENRVN AKAVAVTVAD GIFVNWCGKL GLNRDLTNAV VSYASLALAV ETRPRATKRV FLAAAFWFGV KNTTTWQNLK KVEDVTGVSA GMIRAVESKL 201: ARAMTQQLRR WRVDSEEGWA ENDNV |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)