AT2G40330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PYR1-like 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the PYR (pyrabactin resistance )/PYL(PYR1-like)/RCAR (regulatory components of ABA receptor) family proteins with 14 members. PYR/PYL/RCAR family proteins function as abscisic acid sensors. Mediate ABA-dependent regulation of protein phosphatase 2Cs ABI1 and ABI2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PYR1-like 6 (PYL6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Polyketide cyclase/dehydrase (InterPro:IPR019587); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein (TAIR:AT5G05440.1); Has 471 Blast hits to 471 proteins in 38 species: Archae - 0; Bacteria - 8; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 458; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:16845177..16845824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23844.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 215 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPTSIQFQRS STAAEAANAT VRNYPHHHQK QVQKVSLTRG MADVPEHVEL SHTHVVGPSQ CFSVVVQDVE APVSTVWSIL SRFEHPQAYK HFVKSCHVVI 101: GDGREVGSVR EVRVVSGLPA AFSLERLEIM DDDRHVISFS VVGGDHRLMN YKSVTTVHES EEDSDGKKRT RVVESYVVDV PAGNDKEETC SFADTIVRCN 201: LQSLAKLAEN TSKFS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)