AT5G64750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Integrase-type DNA-binding superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative transcription factor containing an AP2 domain. Is a member of the ERF (ethylene response factor) subfamily B-4 of ERF/AP2 transcription factor family. Expressed in response to ABA, osmotic stress, sugar stress and drought. Mutants are hypersensitive to these stresses. May be involved in regulation of ABA mediated stress response. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ABA REPRESSOR1 (ABR1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding, integrase-type (InterPro:IPR016177), Pathogenesis-related transcriptional factor/ERF, DNA-binding (InterPro:IPR001471); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Integrase-type DNA-binding superfamily protein (TAIR:AT5G61890.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25891679..25893656 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42816.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 391 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCVLKVANQE DNVGKKAESI RDDDHRTLSE IDQWLYLFAA EDDHHRHSFP TQQPPPSSSS SSLISGFSRE MEMSAIVSAL THVVAGNVPQ HQQGGGEGSG 101: EGTSNSSSSS GQKRRREVEE GGAKAVKAAN TLTVDQYFSG GSSTSKVREA SSNMSGPGPT YEYTTTATAS SETSSFSGDQ PRRRYRGVRQ RPWGKWAAEI 201: RDPFKAARVW LGTFDNAESA ARAYDEAALR FRGNKAKLNF PENVKLVRPA STEAQPVHQT AAQRPTQSRN SGSTTTLLPI RPASNQSVHS QPLMQSYNLS 301: YSEMARQQQQ FQQHHQQSLD LYDQMSFPLR FGHTGGSMMQ STSSSSSHSR PLFSPAAVQP PPESASETGY LQDIQWPSDK TSNNYNNSPS S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)