AT3G17390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.500 plasma membrane 0.500 ASURE: nucleus,plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosylmethionine synthetase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
S-adenosylmethionine synthetase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
METHIONINE OVER-ACCUMULATOR 3 (MTO3); FUNCTIONS IN: methionine adenosyltransferase activity; INVOLVED IN: lignin biosynthetic process, response to cold, methionine metabolic process, S-adenosylmethionine biosynthetic process; LOCATED IN: nucleolus, cell wall, plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: S-adenosylmethionine synthetase (InterPro:IPR002133), S-adenosylmethionine synthetase superfamily (InterPro:IPR022636), S-adenosylmethionine synthetase, N-terminal (InterPro:IPR022628), S-adenosylmethionine synthetase, C-terminal (InterPro:IPR022630), S-adenosylmethionine synthetase, conserved site (InterPro:IPR022631), S-adenosylmethionine synthetase, central domain (InterPro:IPR022629); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosylmethionine synthetase 1 (TAIR:AT1G02500.2); Has 10856 Blast hits to 10849 proteins in 2868 species: Archae - 12; Bacteria - 5440; Metazoa - 373; Fungi - 167; Plants - 707; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 4156 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:5952484..5953665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42798.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 393 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESFLFTSES VNEGHPDKLC DQISDAILDA CLEQDPESKV ACETCTKTNM VMVFGEITTK ANVDYEQIVR KTCREIGFVS ADVGLDADNC KVLVNIEQQS 101: PDIAQGVHGH LTKKPEEVGA GDQGHMFGYA TDETPELMPL THVLATKLGA KLTEVRKNGT CPWLRPDGKT QVTIEYINES GAMVPVRVHT VLISTQHDET 201: VTNDEIAADL KEHVIKPVIP EKYLDEKTIF HLNPSGRFVI GGPHGDAGLT GRKIIIDTYG GWGAHGGGAF SGKDPTKVDR SGAYIVRQAA KSIVASGLAR 301: RVIVQVSYAI GVPEPLSVFV DSYGTGKIPD KEILEIVKES FDFRPGMISI NLDLKRGGNG RFLKTAAYGH FGRDDADFTW EVVKPLKSNK VQA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)