AT2G36880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methionine adenosyltransferase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
methionine adenosyltransferase 3 (MAT3); FUNCTIONS IN: copper ion binding, methionine adenosyltransferase activity; INVOLVED IN: one-carbon metabolic process, S-adenosylmethionine biosynthetic process; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 17 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: S-adenosylmethionine synthetase (InterPro:IPR002133), S-adenosylmethionine synthetase superfamily (InterPro:IPR022636), S-adenosylmethionine synthetase, N-terminal (InterPro:IPR022628), S-adenosylmethionine synthetase, C-terminal (InterPro:IPR022630), S-adenosylmethionine synthetase, conserved site (InterPro:IPR022631), S-adenosylmethionine synthetase, central domain (InterPro:IPR022629); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosylmethionine synthetase family protein (TAIR:AT3G17390.1); Has 10904 Blast hits to 10897 proteins in 2898 species: Archae - 12; Bacteria - 5503; Metazoa - 373; Fungi - 167; Plants - 705; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 4143 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15479721..15480893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42499.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 390 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METFLFTSES VNEGHPDKLC DQISDAILDA CLEQDPESKV ACETCTKTNM VMVFGEITTA AKVDYEKIVR STCREIGFIS ADVGLDADKC NVLVNIEQQS 101: PDIAQGVHGH LTKKPEDIGA GDQGHMFGYA TDETPELMPL THVLATKLGA KLTEVRKNKT CPWLRPDGKT QVTVEYKNDG GAMIPIRVHT VLISTQHDET 201: VTNDEIAADL KEHVIKPVIP AKYLDDNTIF HLNPSGRFVI GGPHGDAGLT GRKIIIDTYG GWGAHGGGAF SGKDPTKVDR SGAYIVRQAA KSVVAAGLAR 301: RCIVQVSYAI GVPEPLSVFV DTYKTGTIPD KDILVLIKEA FDFRPGMMAI NLDLKRGGNF RFQKTAAYGH FGRDDPDFTW EVVKPLKPKA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)