AT1G52760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.890 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lysophospholipase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a lysophospholipase 2 (LysoPL2). Involved in tolerance to cadmium-induced oxidative stress. Binds Acyl-CoA-binding protein 2 (ACBP2). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
lysophospholipase 2 (LysoPL2); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT1G11090.1); Has 2373 Blast hits to 2373 proteins in 808 species: Archae - 32; Bacteria - 1418; Metazoa - 106; Fungi - 99; Plants - 433; Viruses - 39; Other Eukaryotes - 246 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:19651378..19652576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36977.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 332 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPSEAESSAN SAPATPPPPP NFWGTMPEEE YYTSQGVRNS KSYFETPNGK LFTQSFLPLD GEIKGTVYMS HGYGSDTSWM FQKICMSFSS WGYAVFAADL 101: LGHGRSDGIR CYMGDMEKVA ATSLAFFKHV RCSDPYKDLP AFLFGESMGG LVTLLMYFQS EPETWTGLMF SAPLFVIPED MKPSKAHLFA YGLLFGLADT 201: WAAMPDNKMV GKAIKDPEKL KIIASNPQRY TGKPRVGTMR ELLRKTQYVQ ENFGKVTIPV FTAHGTADGV TCPTSSKLLY EKASSADKTL KIYEGMYHSL 301: IQGEPDENAE IVLKDMREWI DEKVKKYGSK TA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)