AT5G22360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vesicle-associated membrane protein 714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Member of Synaptobrevin-like AtVAMP7C, v-SNARE protein family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
vesicle-associated membrane protein 714 (VAMP714); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: response to salt stress; LOCATED IN: Golgi apparatus, vacuole, membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Longin (InterPro:IPR010908), Longin-like (InterPro:IPR011012), Synaptobrevin (InterPro:IPR001388); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vesicle-associated membrane protein 713 (TAIR:AT5G11150.1); Has 2317 Blast hits to 2315 proteins in 268 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 867; Fungi - 487; Plants - 553; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 410 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:7404379..7405654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25318.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 221 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIVYAVVAR GTVVLAEFSA VTGNTGAVVR RILEKLSPEI SDERLCFSQD RYIFHILRSD GLTFLCMAND TFGRRVPFSY LEEIHMRFMK NYGKVAHNAP 101: AYAMNDEFSR VLHQQMEFFS SNPSVDTLNR VRGEVSEIRS VMVENIEKIM ERGDRIELLV DKTATMQDSS FHFRKQSKRL RRALWMKNAK LLVLLTCLIV 201: FLLYIIIASF CGGITLPSCR S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)