AT4G14480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT5G14720.1); Has 121171 Blast hits to 119626 proteins in 3383 species: Archae - 90; Bacteria - 13775; Metazoa - 44497; Fungi - 12077; Plants - 30839; Viruses - 477; Other Eukaryotes - 19416 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8330081..8331544 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54383.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 487 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARNKLEFPL DAEAYEIICK IGVGVSASVY KAICIPMNSM VVAIKAIDLD QSRADFDSLR RETKTMSLLS HPNILNAYCS FTVDRCLWVV MPFMSCGSLH 101: SIVSSSFPSG LPENCISVFL KETLNAISYL HDQGHLHRDI KAGNILVDSD GSVKLADFGV SASIYEPVTS SSGTTSSSLR LTDIAGTPYW MAPEVVHSHT 201: GYGFKADIWS FGITALELAH GRPPLSHLPP LKSLLMKITK RFHFSDYEIN TSGSSKKGNK KFSKAFREMV GLCLEQDPTK RPSAEKLLKH PFFKNCKGLD 301: FVVKNVLHSL SNAEQMFMES QILIKSVGDD DEEEEEEDEE IVKNRRISGW NFREDDLQLS PVFPATESDS SESSPREEDQ SKDKKEDDNV TITGYELGLG 401: LSNEEAKNQE GEVVGFDKDL VLEKLKVLKK SLEHQRARVS IIIEALSGDK EEKSREEELL EMVEKLKIEL ETEKLKTLRA DKDSVLG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)