AT1G11340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Apple-like (InterPro:IPR003609), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), EGF-like, type 3 (InterPro:IPR000742), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G11410.1); Has 123060 Blast hits to 121063 proteins in 4656 species: Archae - 122; Bacteria - 13729; Metazoa - 45275; Fungi - 10148; Plants - 35343; Viruses - 433; Other Eukaryotes - 18010 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:3814116..3817420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 102692.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 901 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIIVGVLLVS FTLLSHMNQF LHLFESPTFE IYPELGRDSQ LMTDPLGFQY LHSIYTFSLN PCSETNTNMK VVFVIFFFFL FQFCISVDTI MRRQSLRDGE 101: VILSAGKRFA FGFFSLGDSE LRYVGIWYAQ ISQQTIVWVA NRDHPINDTS GMVKFSNRGN LSVYASDNET ELIWSTNVSD SMLEPTLVAT LSDLGNLVLF 201: DPVTGRSFWE SFDHPTDTFL PFMRLGFTRK DGLDRSLTSW KSHGDPGSGD LILRMERRGF PQLILYKGVT PWWRMGSWTG HRWSGVPEMP IGYIFNNSFV 301: NNEDEVSFTY GVTDASVITR TMVNETGTMH RFTWIARDKR WNDFWSVPKE QCDNYAHCGP NGYCDSPSSK TFECTCLPGF EPKFPRHWFL RDSSGGCTKK 401: KRASICSEKD GFVKLKRMKI PDTSDASVDM NITLKECKQR CLKNCSCVAY ASAYHESKRG AIGCLKWHGG MLDARTYLNS GQDFYIRVDK EELARWNRNG 501: LSGKRRVLLI LISLIAAVML LTVILFCVVR ERRKSNRHRS SSANFAPVPF DFDESFRFEQ DKARNRELPL FDLNTIVAAT NNFSSQNKLG AGGFGPVYKG 601: VLQNRMEIAV KRLSRNSGQG MEEFKNEVKL ISKLQHRNLV RILGCCVELE EKMLVYEYLP NKSLDYFIFH EEQRAELDWP KRMEIVRGIA RGILYLHQDS 701: RLRIIHRDLK ASNILLDSEM IPKISDFGMA RIFGGNQMEG CTSRVVGTFG YMAPEYAMEG QFSIKSDVYS FGVLMLEIIT GKKNSAFHEE SSNLVGHIWD 801: LWENGEATEI IDNLMDQETY DEREVMKCIQ IGLLCVQENA SDRVDMSSVV IMLGHNATNL PNPKHPAFTS ARRRGGENGA CLKGQTGISV NDVTFSDIQG 901: R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)