AT1G12480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a membrane protein with 10 predicted transmembrane helices. SLAC1 is a multispanning membrane protein expressed predominantly in guard cells that plays a role in regulating cellular ion homeostasis and S-type anion currents. SLAC1 is important for normal stomatal closure in response to a variety of signals including elevated CO2, ozone, ABA, darkness, and humidity. SLAC1:GFP localizes to the plasma membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
OZONE-SENSITIVE 1 (OZS1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein (InterPro:IPR004695); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: SLAC1 homologue 3 (TAIR:AT5G24030.1); Has 903 Blast hits to 900 proteins in 365 species: Archae - 17; Bacteria - 650; Metazoa - 0; Fungi - 31; Plants - 165; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 40 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:4257427..4259249 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63238.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 556 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MERKQSNAHS TFADINEVED EAEQELQQQE NNNNKRFSGN RGPNRGKQRP FRGFSRQVSL ETGFSVLNRE SRERDDKKSL PRSGRSFGGF ESGGIINGGD 101: GRKTDFSMFR TKSTLSKQKS LLPSIIRERD IENSLRTEDG ETKDDSINEN VSAGRYFAAL RGPELDEVKD NEDILLPKEE QWPFLLRFPI GCFGICLGLS 201: SQAVLWLALA KSPATNFLHI TPLINLVVWL FSLVVLVSVS FTYILKCIFY FEAVKREYFH PVRVNFFFAP WVVCMFLAIS VPPMFSPNRK YLHPAIWCVF 301: MGPYFFLELK IYGQWLSGGK RRLCKVANPS SHLSVVGNFV GAILASKVGW DEVAKFLWAV GFAHYLVVFV TLYQRLPTSE ALPKELHPVY SMFIAAPSAA 401: SIAWNTIYGQ FDGCSRTCFF IALFLYISLV ARINFFTGFK FSVAWWSYTF PMTTASVATI KYAEAVPGYP SRALALTLSF ISTAMVCVLF VSTLLHAFVW 501: QTLFPNDLAI AITKRKLTRE KKPFKRAYDL KRWTKQALAK KISAEKDFEA EEESHH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)