AT2G46070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mitogen-activated protein kinase 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a MAP kinase protein. MPK12 interacts with the IBR5 protein phosphatase in vitro and in vivo, and it can be dephosphorylated and inactivated by IBR5. MPK12 appears to be a negative regulator of auxin signlaing. MPK12 RNAi lines are hypersensitive to auxin in root elongation and transcriptional response assays, but they appear to have normal sensitivity to ABA. MPK12 is a nuclear protein and its kinase activity is increased following auxin treatment. MPK12 transcripts are widely expressed in seedlings, but MPK12 expression is stronger in guard cells than in other cell types in mature plants. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mitogen-activated protein kinase 12 (MPK12); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), JNK MAP kinase (InterPro:IPR008351), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Tyrosine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008266), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase 4 (TAIR:AT4G01370.1); Has 125734 Blast hits to 124415 proteins in 4732 species: Archae - 106; Bacteria - 13752; Metazoa - 47505; Fungi - 12616; Plants - 30542; Viruses - 578; Other Eukaryotes - 20635 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18946134..18947770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42477.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 372 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSGESSSGST EHCIKVVPTH GGRYVQYNVY GQLFEVSRKY VPPIRPIGRG ACGIVCAAVN SVTGEKVAIK KIGNAFDNII DAKRTLREIK LLRHMDHENV 101: ITIKDIVRPP QRDIFNDVYI VYELMDTDLQ RILRSNQTLT SDQCRFLVYQ LLRGLKYVHS ANILHRDLRP SNVLLNSKNE LKIGDFGLAR TTSDTDFMTE 201: YVVTRWYRAP ELLLNCSEYT AAIDIWSVGC ILGEIMTGQP LFPGKDYVHQ LRLITELVGS PDNSSLGFLR SDNARRYVRQ LPRYPKQQFA ARFPKMPTTA 301: IDLLERMLVF DPNRRISVDE ALGHAYLSPH HDVAKEPVCS TPFSFDFEHP SCTEEHIKEL IYKESVKFNP DH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)