AT1G18350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase kinase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
MAP kinase kinase7. Member of plant mitogen-activated protein kinase kinase group D. Negative regulator of polar auxin transport. Overexpression leads to activation of basal and systemic acquired resistance. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase kinase 7 (MKK7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase kinase 9 (TAIR:AT1G73500.1); Has 127926 Blast hits to 126631 proteins in 4862 species: Archae - 158; Bacteria - 14837; Metazoa - 47772; Fungi - 12215; Plants - 31900; Viruses - 488; Other Eukaryotes - 20556 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6315686..6316609 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34273.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 307 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALVRKRRQI NLRLPVPPLS VHLPWFSFAS STAPVINNGI SASDVEKLHV LGRGSSGIVY KVHHKTTGEI YALKSVNGDM SPAFTRQLAR EMEILRRTDS 101: PYVVRCQGIF EKPIVGEVSI LMEYMDGGNL ESLRGAVTEK QLAGFSRQIL KGLSYLHSLK IVHRDIKPAN LLLNSRNEVK IADFGVSKII TRSLDYCNSY 201: VGTCAYMSPE RFDSAAGENS DVYAGDIWSF GVMILELFVG HFPLLPQGQR PDWATLMCVV CFGEPPRAPE GCSDEFRSFV DCCLRKESSE RWTASQLLGH 301: PFLRESL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)