AT1G73670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.776 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of MAP Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase 15 (MPK15); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT1G18150.3); Has 118424 Blast hits to 117259 proteins in 3821 species: Archae - 110; Bacteria - 13457; Metazoa - 43793; Fungi - 12258; Plants - 28693; Viruses - 571; Other Eukaryotes - 19542 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27700212..27703168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65254.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 576 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGGGGNLVDG VRRWLFFQRR PSSSSSSNNH DQIQNPPTVS NPNDDEDLKK LTDPSKLRQI KVQQRNHLPM EKKGIPNAEF FTEYGEANRY QIQEVVGKGS 101: YGVVGSAIDT HTGERVAIKK INDVFDHISD ATRILREIKL LRLLLHPDVV EIKHIMLPPS RREFRDVYVV FELMESDLHQ VIKANDDLTP EHHQFFLYQL 201: LRGLKYVHAA NVFHRDLKPK NILANADCKL KICDFGLARV SFNDAPTAIF WTDYVATRWY RAPELCGSFF SKYTPAIDIW SVGCIFAEML LGKPLFPGKN 301: VVHQLDIMTD FLGTPPPEAI SKIRNDKARR YLGNMRKKQP VPFSKKFPKA DPSALRLLER LIAFDPKDRP SAEEALADPY FNGLSSKVRE PSTQPISKLE 401: FEFERKKLTK DDIRELIYRE ILEYHPQMLE EYLRGGNQLS FMYPSGVDRF RRQFAHLEEN QGPGGRSNAL QRQHASLPRE RVPASKNETV EERSNDIERR 501: TTAAVASTLD SPKASQQAEG TENGGGGGYS ARNLMKSSSI SGSKCIGVQS KTNIEDSIVE EQDETVAVKV ASLHNS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)