AT1G07340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.947 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sugar transporter 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
sugar transporter 2 (STP2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT5G26250.1); Has 22673 Blast hits to 22229 proteins in 1760 species: Archae - 425; Bacteria - 7839; Metazoa - 4193; Fungi - 6598; Plants - 2480; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1138 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2254873..2256712 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55026.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 498 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVGSMNVEE GTKAFPAKLT GQVFLCCVIA AVGGLMFGYD IGISGGVTSM DTFLLDFFPH VYEKKHRVHE NNYCKFDDQL LQLFTSSLYL AGIFASFISS 101: YVSRAFGRKP TIMLASIFFL VGAILNLSAQ ELGMLIGGRI LLGFGIGFGN QTVPLFISEI APARYRGGLN VMFQFLITIG ILAASYVNYL TSTLKNGWRY 201: SLGGAAVPAL ILLIGSFFIH ETPASLIERG KDEKGKQVLR KIRGIEDIEL EFNEIKYATE VATKVKSPFK ELFTKSENRP PLVCGTLLQF FQQFTGINVV 301: MFYAPVLFQT MGSGDNASLI STVVTNGVNA IATVISLLVV DFAGRRCLLM EGALQMTATQ MTIGGILLAH LKLVGPITGH AVPLIVLILI CVYVSGFAWS 401: WGPLGWLVPS EIYPLEVRNA GYFCAVAMNM VCTFIIGQFF LSALCRFRSL LFFFFGIMNI IMGLFVVFFL PETKGVPIEE MAEKRWKTHP RWKKYFKD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)