AT1G59580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.616 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mitogen-activated protein kinase homolog 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a mitogen-activated kinase involved in innate immunity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mitogen-activated protein kinase homolog 2 (MPK2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mitogen-activated protein kinase 1 (TAIR:AT1G10210.2); Has 121192 Blast hits to 119674 proteins in 4402 species: Archae - 98; Bacteria - 12397; Metazoa - 46062; Fungi - 12260; Plants - 29633; Viruses - 469; Other Eukaryotes - 20273 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:21884521..21885743 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43127.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 376 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATPVDPPNG IRNQGKHYFS MWQTLFEIDT KYVPIKPIGR GAYGVVCSSV NRESNERVAI KKIHNVFENR IDALRTLREL KLLRHLRHEN VVALKDVMMA 101: NHKRSFKDVY LVYELMDTDL HQIIKSSQVL SNDHCQYFLF QLLRGLKYIH SANILHRDLK PGNLLVNANC DLKICDFGLA RTSNTKGQFM TEYVVTRWYR 201: APELLLCCDN YGTSIDVWSV GCIFAELLGR KPVFPGTECL NQIKLIINIL GSQREEDLEF IDNPKAKRYI ESLPYSPGIS FSRLYPGANV LAIDLLQKML 301: VLDPSKRISV TEALQHPYMA PLYDPSANPP AQVPIDLDVD EDEDLGAEMI RELMWKEMIH YHPEAATINN NEVSEF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)