AT3G13720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.878 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PRA1 (Prenylated rab acceptor) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
PRA8; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prenylated rab acceptor PRA1 (InterPro:IPR004895); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: prenylated RAB acceptor 1.F4 (TAIR:AT3G13710.1); Has 408 Blast hits to 408 proteins in 77 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 29; Fungi - 28; Plants - 309; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 42 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:4495202..4495768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21117.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 188 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTNYGAIPTS SHASPLVDVE SLSRAKHRIK AGLATRRAWR VMFDFHSMGL PHGVSDAFTR IKTNLAYFRM NYAIVVLIVI FFSLIWHPTS LIVFTVLVVV 101: WIFLYFLRDE PIKLFRFQID DRTVLIVLSV LTVVLLLLTN ATFNIVGALV TGAVLVLIHS VVRKTEDLFL DEEAATTETS GLTSYPST |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)