AT2G29700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.511 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pleckstrin homologue 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein containing one PH (pleckstrin homology) domain with a short N-terminal extension | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pleckstrin homologue 1 (PH1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pleckstrin homology-type (InterPro:IPR011993), Pleckstrin homology (InterPro:IPR001849); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pleckstrin homology (PH) domain superfamily protein (TAIR:AT5G05710.1); Has 2358 Blast hits to 2352 proteins in 131 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1854; Fungi - 32; Plants - 108; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 361 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12697571..12698008 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16811.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 145 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESIWRIATG QDPSREDYEG IEFWSNPERS GWLTKQGDYI KTWRRRWFVL KRGKLLWFKD QAAAGIRGST PRGVISVGDC LTVKGAEDVV NKPFAFELSS 101: GSYTMFFIAD NEKEKEEWIN SIGRSIVQHS RSVTDSEVLD YDHRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)