AT4G01120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : G-box binding factor 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
bZIP (basic leucine zipper) transcription factor that binds to the G-box regulatory element found in many plant promoters. GBF2 nuclear localization is increased by blue light | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
G-box binding factor 2 (GBF2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor (InterPro:IPR004827), G-box binding, MFMR (InterPro:IPR012900), bZIP transcription factor, bZIP-1 (InterPro:IPR011616); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: G-box binding factor 3 (TAIR:AT2G46270.2); Has 2070 Blast hits to 2052 proteins in 232 species: Archae - 2; Bacteria - 25; Metazoa - 517; Fungi - 137; Plants - 1237; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 151 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:481929..483970 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38790.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 360 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSNEEGNPT NNSDKPSQAA APEQSNVHVY HHDWAAMQAY YGPRVGIPQY YNSNLAPGHA PPPYMWASPS PMMAPYGAPY PPFCPPGGVY AHPGVQMGSQ 101: PQGPVSQSAS GVTTPLTIDA PANSAGNSDH GFMKKLKEFD GLAMSISNNK VGSAEHSSSE HRSSQSSEND GSSNGSDGNT TGGEQSRRKR RQQRSPSTGE 201: RPSSQNSLPL RGENEKPDVT MGTPVMPTAM SFQNSAGMNG VPQPWNEKEV KREKRKQSNR ESARRSRLRK QAETEQLSVK VDALVAENMS LRSKLGQLNN 301: ESEKLRLENE AILDQLKAQA TGKTENLISR VDKNNSVSGS KTVQHQLLNA SPITDPVAAS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)