AT2G46270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : G-box binding factor 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a bZIP G-box binding protein whose expression is induced by ABA. It has been shown to bind to Adh that contains the G-box and is induced by cold and water deprivation. GBF3 has been shown to be expressed mostly in the root and dark-grown leaves. GBF3 can act as homodimers and as heterodimers with GFB1, GBF2 and GBF4. In addition, GBF3??s DNA binding activity is enhanced by GIP1, GPRI1 and GPRI2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
G-box binding factor 3 (GBF3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor (InterPro:IPR004827), G-box binding, MFMR (InterPro:IPR012900), bZIP transcription factor, bZIP-1 (InterPro:IPR011616); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: G-box binding factor 2 (TAIR:AT4G01120.1); Has 2267 Blast hits to 2266 proteins in 215 species: Archae - 0; Bacteria - 77; Metazoa - 736; Fungi - 40; Plants - 1305; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 101 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:19000859..19002901 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41116.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 382 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNSSEEPKP PTKSDKPSSP PVDQTNVHVY PDWAAMQAYY GPRVAMPPYY NSAMAASGHP PPPYMWNPQH MMSPYGAPYA AVYPHGGGVY AHPGIPMGSL 101: PQGQKDPPLT TPGTLLSIDT PTKSTGNTDN GLMKKLKEFD GLAMSLGNGN PENGADEHKR SRNSSETDGS TDGSDGNTTG ADEPKLKRSR EGTPTKDGKQ 201: LVQASSFHSV SPSSGDTGVK LIQGSGAILS PGVSANSNPF MSQSLAMVPP ETWLQNEREL KRERRKQSNR ESARRSRLRK QAETEELARK VEALTAENMA 301: LRSELNQLNE KSDKLRGANA TLLDKLKCSE PEKRVPANML SRVKNSGAGD KNKNQGDNDS NSTSKLHQLL DTKPRAKAVA AG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)