AT3G61260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Remorin family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Remorin family protein; FUNCTIONS IN: binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Remorin, C-terminal (InterPro:IPR005516), Remorin, N-terminal (InterPro:IPR005518); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Remorin family protein (TAIR:AT2G45820.1); Has 8155 Blast hits to 5353 proteins in 884 species: Archae - 12; Bacteria - 2269; Metazoa - 1454; Fungi - 651; Plants - 718; Viruses - 174; Other Eukaryotes - 2877 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:22675403..22676701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23145.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 212 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEEQKIALE SESPAKVTTP APADTPAPAP AEIPAPAPAP TPADVTKDVA EEKIQNPPPE QIFDDSKALT VVEKPVEEPA PAKPASASLD RDVKLADLSK 101: EKRLSFVRAW EESEKSKAEN KAEKKIADVH AWENSKKAAV EAQLKKIEEQ LEKKKAEYAE RMKNKVAAIH KEAEERRAMI EAKRGEDVLK AEETAAKYRA 201: TGIVPKATCG CF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)