AT2G45820.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Remorin family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
Remorin family protein; FUNCTIONS IN: DNA binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Remorin, C-terminal (InterPro:IPR005516), Remorin, N-terminal (InterPro:IPR005518); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Remorin family protein (TAIR:AT3G61260.1); Has 2543 Blast hits to 1840 proteins in 340 species: Archae - 2; Bacteria - 408; Metazoa - 392; Fungi - 191; Plants - 500; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 1046 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18863147..18864576 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 20969.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 9.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 190 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEEQKTSKV DVESPAVLAP AKEPTPAPVE VADEKIHNPP PVESKALAVV EKPIEEHTPK KASSGSADRD VILADLEKEK KTSFIKAWEE SEKSKAENRA 101: QKKISDVHAW ENSKKAAVEA QLRKIEEKLE KKKAQYGEKM KNKVAAIHKL AEEKRAMVEA KKGEELLKAE EMGAKYRATG VVPKATCGCF |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)