AT1G77290.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Glutathione S-transferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Glutathione S-transferase family protein; INVOLVED IN: pentachlorophenol catabolic process; LOCATED IN: plasma membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutathione S-transferase, C-terminal (InterPro:IPR004046), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione S-transferase (class phi) 5 (TAIR:AT1G02940.1); Has 4039 Blast hits to 4036 proteins in 870 species: Archae - 0; Bacteria - 1980; Metazoa - 523; Fungi - 103; Plants - 679; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 754 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29038917..29039815 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31508.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 266 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQLYHHPYSI DSQRVRLALE EKGIDYTSYH VNPITGKHMD PSFFRMNPNA KLPVFRNGSH IILDTIEIIE YLERIAEVSS GIEDATFNRE VVEWMRKIRE 101: WESKLFTLAH IPDNRRLYVS KFLRMVVIAR MAESPDLASA YHRKLREAYD TEDKLKDPGA LRRSKDHLLR LLDEVETKLE GTTYLAGNEF SMADVMLIPV 201: LARLSLLDLE EEYISSRKNL AEYWALVRRR PSYKKVIGRY FNGWRKYATL VKTWMFVRVR SLLRKY |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)