AT3G05870.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : anaphase-promoting complex/cyclosome 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Subunit of the anaphase promoting complex, a ubiquitin ligase complex that regulates progression through the cell cycle. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
anaphase-promoting complex/cyclosome 11 (APC11); FUNCTIONS IN: ubiquitin-protein ligase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: regulation of mitotic cell cycle; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, RING-type (InterPro:IPR001841); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RING-box 1 (TAIR:AT5G20570.1); Has 1040 Blast hits to 1040 proteins in 226 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 451; Fungi - 227; Plants - 173; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 189 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:1753961..1754802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 10106.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 87 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MKVKILRILL WHAVASWTWD AQDETCGICR MAFDGCCPDC KLPGDDCPLI WGACNHAFHL HCILKWVNSQ TSQAHCPMCR REWQFKE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)