AT2G38130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.989 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes the Arabidopsis homolog of the yeast protein MAK3, a component of the N-terminal acetyltransferase complex C. In mutant plants, synthesis of plastome-encoded photosystem II core proteins D1 and CP47 is affected resulting in fewer thylakoid multiprotein complexes. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATMAK3; FUNCTIONS IN: N-acetyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GCN5-related N-acetyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR022610), GCN5-related N-acetyltransferase (InterPro:IPR000182), Acyl-CoA N-acyltransferase (InterPro:IPR016181); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein (TAIR:AT5G13780.1); Has 3613 Blast hits to 3609 proteins in 1331 species: Archae - 279; Bacteria - 1857; Metazoa - 641; Fungi - 294; Plants - 213; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 329 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15978639..15980145 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22123.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 190 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKEMEDKEE FDEGEIEYTS YAGEHHLPLI MSLVDQELSE PYSIFTYRYF VYLWPQLCFL AFHKGKCVGT IVCKMGDHRQ TFRGYIAMLV VIKPYRGRGI 101: ASELVTRAIK AMMESGCEEV TLEAEVSNKG ALALYGRLGF IRAKRLYHYY LNGMDAFRLK LLFPKPRVPQ IPSQVQTQQE YETFPRPRVP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)