AT2G28060.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.786 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 5'-AMP-activated protein kinase beta-2 subunit protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
5'-AMP-activated protein kinase beta-2 subunit protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 5-AMP-activated protein kinase, beta subunit, interaction domain (InterPro:IPR006828); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 5'-AMP-activated protein kinase beta-2 subunit protein (TAIR:AT5G21170.2); Has 379 Blast hits to 379 proteins in 106 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 199; Fungi - 21; Plants - 141; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 18 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11950174..11950618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12705.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 114 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNSQNPDDHE DTTVVGFEVP VSPVSSYNNV YSSTEDETRD PPAVPPHLQH SLLGNQGSME LAYAPQNVVL NHLYIENRDA PRSVVALGFS HRFRTKFVTV 101: VIYKPVQRRG SANV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)