AT5G64370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta-ureidopropionase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
PYD3 encodes a beta-ureidopropionase which, when expressed in E. coli, has been shown to convert beta-ureidopropionate into beta-alanine. It localizes to the cytosol and plays an important role in uracil degradation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
beta-ureidopropionase (BETA-UP); FUNCTIONS IN: beta-ureidopropionase activity; INVOLVED IN: nitrogen compound metabolic process, uracil catabolic process, cellular response to nitrogen levels; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase (InterPro:IPR003010); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nitrilase-like protein 1 (TAIR:AT2G27450.2); Has 6588 Blast hits to 6556 proteins in 1697 species: Archae - 146; Bacteria - 4263; Metazoa - 430; Fungi - 262; Plants - 305; Viruses - 11; Other Eukaryotes - 1171 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25739264..25741031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45555.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 408 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDHMISENGE TSAEGSICGY DSLHQLLSAN LKPELYQEVN RLLLGRNCGR SLEQIVLPES AKALSSKHDF DLQAASFSAD KEQMRNPRVV RVGLIQNSIA 101: LPTTAPFSDQ TRGIFDKLKP IIDAAGVAGV NILCLQEAWT MPFAFCTRER RWCEFAEPVD GESTKFLQEL AKKYNMVIVS PILERDIDHG EVLWNTAVII 201: GNNGNIIGKH RKNHIPRVGD FNESTYYMEG DTGHPVFETV FGKIAVNICY GRHHPLNWLA FGLNGAEIVF NPSATVGELS EPMWPIEARN AAIANSYFVG 301: SINRVGTEVF PNPFTSGDGK PQHNDFGHFY GSSHFSAPDA SCTPSLSRYK DGLLISDMDL NLCRQYKDKW GFRMTARYEV YADLLAKYIK PDFKPQVVSD 401: PLLHKNST |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)