AT2G25280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.647 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UPF0103/Mediator of ErbB2-driven cell motility (Memo), related (InterPro:IPR002737); Has 1074 Blast hits to 1072 proteins in 474 species: Archae - 213; Bacteria - 366; Metazoa - 159; Fungi - 135; Plants - 54; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 147 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10762639..10764631 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32645.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 291 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKIRQPTHA GSWYTDNPTK LSSDLEEWLN ATGLTKSPDV RGVIAPHAGY SYSGRAAAYA FANIDPTNIS RIFLLGPSHH FYTPKCALST ATVYKTPIGN 101: LPVDVEMIKE IRAMGKFGMM DLRVDEAEHS MEMHLPYLAK VFEGNNVKVV PILVGAVSPE NEAMYGELLA KYVDDPKNFF SVSSDFCHWG SRFNYMHYDN 201: THGAIHKSIE ALDKKGMDII ETGDPDAFKK YLLEFENTIC GRHPISIFLH MLKHSSSKIK INFLRYEQSS QCQTMRDSSV SYASAAAKLE T |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)