AT4G13360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein; FUNCTIONS IN: catalytic activity; INVOLVED IN: metabolic process; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Crotonase, core (InterPro:IPR001753); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein (TAIR:AT3G24360.1); Has 20226 Blast hits to 20218 proteins in 1812 species: Archae - 355; Bacteria - 13945; Metazoa - 843; Fungi - 613; Plants - 486; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3984 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:7775133..7777701 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46253.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 421 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIIIKTLSHR IFFPKFSQTF SSQFHQTLRF SISDRRKFSA MAGAGVDDFV KGNVFPNGVA LITLDRTKAL NAMNLDMDIK YKSFLDEWES DPRVKCVIVE 101: GSTSRAFCAG MDIKGVAAEI QKDKNTPLVQ KVFTAEYTLI CAIAAYKKPY ISLMDGITMG FGLGLSGHGR YRVITERTVL AMPENGIGLF PDVGFSYIAA 201: HSPGGGSVGA YLGLTGKRIS APSDALFVGL GTHYVPSEKL ASLKEAILSA NLSEDPNQDI QATLSKYSSN PESEAHLKSL LPHIESAFSS NKSIKETIEE 301: LKKYQQSTES SVVEWANEAL KGLEKGAPFS LYLTQKYFSN VACAKSKPEN ELATLNGVMK TEYRIALRSA LRGDFAEGVR AVLIDKDQNP KWNPTSIEEV 401: DENEVEALFK PLSPEVEELK V |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)