AT2G30580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DREB2A-interacting protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a C3HC4 RING-domain-containing ubiquitin E3 ligase capable of interacting with DREB2A. DRIP2 seems to be involved in regulating stress-related transcriptional changes and drought tolerance. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DREB2A-interacting protein 2 (DRIP2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, RING-type, conserved site (InterPro:IPR017907), Zinc finger, RING-type (InterPro:IPR001841), Zinc finger, C3HC4 RING-type (InterPro:IPR018957); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DREB2A-interacting protein 1 (TAIR:AT1G06770.1); Has 1631 Blast hits to 1626 proteins in 163 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 1227; Fungi - 58; Plants - 232; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 112 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13026444..13030363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47192.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 420 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGDMVAKVK RETVVACMTC PLCDKLLRDA TTISECLHTF CRKCIYEKIT EDEIESCPVC DIDLGGTPLE KLRPDHILQD LRAKLFPLKR KKERAPEVVS 101: SISLPAKRKE RSISSLVVST PRVSAQAGTT GKRTKAATRK DVRGSGSFTK RTVKKEEEFG DDHVESASSP ETLKKFTQNK RQSSYANPNQ SLSNRRNKDV 201: DEPWDSKLHL WKPLNFLVDV ANGTKDPKSE LGNASHNDVQ GSKTKTKDHK RKCKLEEEIS NNGDPTTSET ATLKRTRRTR RKRSSTFGDS RIPLLPGAAS 301: LKQERRNGHV WFSLVASSNQ EGEASLPQIP ANYLRIRDGN IPVSFIQKYL MRKLDLKSED EVEITCMGEP VIPTLQLHSL VDLWLETTSK HQRVAASIGS 401: SAKEFVMVLV YSRKLPECNN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)