AT3G26670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.986 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein of unknown function (DUF803) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein of unknown function (DUF803); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF803 (InterPro:IPR008521); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein of unknown function (DUF803) (TAIR:AT3G23870.1); Has 1048 Blast hits to 1038 proteins in 170 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 347; Fungi - 379; Plants - 231; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 89 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9798236..9800562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48411.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 441 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGEWVIGAFI NIFGSVAINF GTNLLKLGHN ERERLALQDG GGKMPLKPII HNQTWRVGIL VFLLGNCLNF ISFGYAAQSL LAALGSIQFV SNIAFAYVVL 101: NKMVTVKVLV ATAFIVLGNV FLVAFGNHQS PVFTPEQLAE KYSNVTFLVY CGILILIVAV HHFLYRKGEV LISTPGQEIS SYWKMLLPFS YAVVSGAIGS 201: CSVLFAKSLS NLLRLAMSSS YQLHSWFTYS MLLLFLSTAG FWMTRLNEGL SLYDAILIVP MFQIAWTFFS ICTGCIYFQE FQVFDALRTT MFILGMMCVF 301: IGISLLAPDD TRGNETKDNS SSLDSIVSSS VPTEEDRLIP QSSEDGHSKD TRVVVQGMYM KAADLIAKTK TACLAALGFG EDSINASAIL VMPMVSSKIT 401: GFRGNGLERA KILSMRGSGW SKLAMEEEGT RMLEKTISSK A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)