AT2G29570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : proliferating cell nuclear antigen 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Functionally interacts with POLH to repair DNA damaged by UVB damage. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
proliferating cell nuclear antigen 2 (PCNA2); FUNCTIONS IN: DNA binding, DNA polymerase processivity factor activity; INVOLVED IN: regulation of DNA replication, error-prone translesion synthesis; LOCATED IN: PCNA complex, nucleus; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Proliferating cell nuclear antigen, PCNA (InterPro:IPR000730), Proliferating cell nuclear antigen, PCNA, C-terminal (InterPro:IPR022649), Proliferating cell nuclear antigen, PCNA, conserved site (InterPro:IPR022659), Proliferating cell nuclear antigen, PCNA, N-terminal (InterPro:IPR022648); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: proliferating cellular nuclear antigen 1 (TAIR:AT1G07370.1); Has 1860 Blast hits to 1848 proteins in 457 species: Archae - 391; Bacteria - 0; Metazoa - 314; Fungi - 169; Plants - 159; Viruses - 73; Other Eukaryotes - 754 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:12650139..12651598 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29224.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 264 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLELRLVQGS LLKKVLEAVK DLVNDANFDC STTGFSLQAM DSSHVALVSL LLRSEGFEHY RCDRNLSMGM NLGNMSKMLK CAGNDDIITI KADDGSDTVT 101: FMFESPTQDK IADFEMKLMD IDSEHLGIPD AEYHSIVRMP SGEFSRICKD LSSIGDTVVI SVTKEGVKFS TAGDIGTANI VLRQNTTVDK PEDAIVIEMN 201: EPVSLSFALR YMNSFTKATP LSETVTISLS SELPVVVEYK VAEMGYIRYY LAPKIEEEED TKPE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)