AT2G29410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.545 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : metal tolerance protein B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Zinc transporter (ZAT) family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
metal tolerance protein B1 (MTPB1); FUNCTIONS IN: efflux transmembrane transporter activity, zinc ion transmembrane transporter activity, inorganic anion transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: zinc ion transport, cation transport, transmembrane transport; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: leaf whorl, male gametophyte, flower, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cation efflux protein (InterPro:IPR002524); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: zinc transporter of Arabidopsis thaliana (TAIR:AT2G46800.2); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12616810..12617937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42342.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 375 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELEQICILK PDDEEEMESP SPSKTEENLG VVPLSCAFTR QEHCVSETKE REESTRRLSS LIFLYLIVMS VQIVGGFKAN SLAVMTDAAH LLSDVAGLCV 101: SLLAIKVSSW EANPRNSFGF KRLEVLAAFL SVQLIWLVSG VIIHEAIQRL LSRSREVNGE IMFGISAFGF FMNLVMVLWL GHNHSHHHHD HHHHHHNHKH 201: QHQHHHKEVV AEEEEEEMNP LKGEKSSSKE MNINIQGAYL HAMADMIQSL GVMIGGGIIW VKPKWVLVDL ICTLVFSAFA LAATLPILKN IFGILMERVP 301: RDMDIEKLER GLKRIDGVKI VYDLHVWEIT VGRIVLSCHI LPEPGASPKE IITGVRNFCR KSYGIYHATV QVESE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)