AT1G19570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.505 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dehydroascorbate reductase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the dehydroascorbate reductase gene family. Critical for a mutualistic symbiosis between the host Arabidopsis and the root colonizing fungus Piriformospora indica. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
dehydroascorbate reductase (DHAR1); FUNCTIONS IN: copper ion binding, glutathione dehydrogenase (ascorbate) activity; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 7 plant structures; EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutathione S-transferase, C-terminal (InterPro:IPR004046), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: dehydroascorbate reductase 2 (TAIR:AT1G75270.1); Has 5234 Blast hits to 5161 proteins in 1116 species: Archae - 0; Bacteria - 2090; Metazoa - 1076; Fungi - 186; Plants - 896; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 986 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6773462..6774413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23642.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 213 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALEICVKAA VGAPDHLGDC PFSQRALLTL EEKSLTYKIH LINLSDKPQW FLDISPQGKV PVLKIDDKWV TDSDVIVGIL EEKYPDPPLK TPAEFASVGS 101: NIFGTFGTFL KSKDSNDGSE HALLVELEAL ENHLKSHDGP FIAGERVSAV DLSLAPKLYH LQVALGHFKS WSVPESFPHV HNYMKTLFSL DSFEKTKTEE 201: KYVISGWAPK VNP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)