AT5G24770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vegetative storage protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Has acid phosphatase activity dependent on the presence of divalent cations (Mg2+, Co2+, Zn2+, Mn2+) and anti-insect activity. Insects fed with the protein show a retarded development. Induced in response to abscisic acid, jasmonic acid, salt, water deficiency and wounding. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
vegetative storage protein 2 (VSP2); FUNCTIONS IN: acid phosphatase activity; INVOLVED IN: in 8 processes; LOCATED IN: cytosolic ribosome, vacuole; EXPRESSED IN: fruit, flower, leaf; EXPRESSED DURING: seedling growth, 4 leaf senescence stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acid phosphatase (Class B) (InterPro:IPR005519), Vegetative storage protein/acid phosphatase (InterPro:IPR014403), Acid phosphatase, plant (InterPro:IPR010028); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vegetative storage protein 1 (TAIR:AT5G24780.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:8500713..8501844 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29843.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 265 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKILSLSLLL LLAATVSASV PGLIELVDSK TIFGNVAELL EKEKLSINYA NCRSWHLGVE TSNIIDFDTV PANCKDYVED YLITSKQYQY DSKTVCKEAY 101: FYAKGLALKN DTVNVWIFDL DDTLLSSIPY YAKYGYGTEK TDPGAYWLWL GTGASTPGLP EALHLYQNII ELGIEPIILS DRWKLWKNVT LDNLEAAGVT 201: YWKHLILKPN GSNLRQVVYK SKVRKSLVKK GYNIVGNIGD QWADLVEDTP GRVFKLPNPL YYVPS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)