AT1G05680.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 0.935 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Uridine diphosphate glycosyltransferase 74E2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a UDP-glucosyltransferase, UGT74E2, that acts on IBA (indole-3-butyric acid) and affects auxin homeostasis. The transcript and protein levels of this enzyme are strongly induced by H2O2 and may allow integration of ROS (reactive oxygen species) and auxin signaling. This enzyme can also transfer glycosyl groups to several compounds related to the explosive TNT when this synthetic compound is taken up from the environment. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
Uridine diphosphate glycosyltransferase 74E2 (UGT74E2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT1G05675.1); Has 8397 Blast hits to 8309 proteins in 513 species: Archae - 0; Bacteria - 605; Metazoa - 2499; Fungi - 31; Plants - 5061; Viruses - 123; Other Eukaryotes - 78 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:-:1703196..1704639 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 51053.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 453 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MREGSHLIVL PFPGQGHITP MSQFCKRLAS KGLKLTLVLV SDKPSPPYKT EHDSITVFPI SNGFQEGEEP LQDLDDYMER VETSIKNTLP KLVEDMKLSG 101: NPPRAIVYDS TMPWLLDVAH SYGLSGAVFF TQPWLVTAIY YHVFKGSFSV PSTKYGHSTL ASFPSFPMLT ANDLPSFLCE SSSYPNILRI VVDQLSNIDR 201: VDIVLCNTFD KLEEKLLKWV QSLWPVLNIG PTVPSMYLDK RLSEDKNYGF SLFNAKVAEC MEWLNSKEPN SVVYLSFGSL VILKEDQMLE LAAGLKQSGR 301: FFLWVVRETE THKLPRNYVE EIGEKGLIVS WSPQLDVLAH KSIGCFLTHC GWNSTLEGLS LGVPMIGMPH WTDQPTNAKF MQDVWKVGVR VKAEGDGFVR 401: REEIMRSVEE VMEGEKGKEI RKNAEKWKVL AQEAVSEGGS SDKSINEFVS MFC |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)