AT2G03760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.972 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulphotransferase 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a brassinosteroid sulfotransferase. In vitro experiements show that this enzyme has a preference for 24-epibrassinosteroids, particularly 24-epicathasterone, but does not act on castasterone and brassinolide. It is differentially expressed during development, being more abundant in young seedlings and actively growing cell cultures. Expression is induced in response to salicylic acid and methyl jasmonate and bacterial pathogens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulphotransferase 12 (SOT12); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulfotransferase domain (InterPro:IPR000863); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein (TAIR:AT2G03770.1); Has 2910 Blast hits to 2872 proteins in 198 species: Archae - 0; Bacteria - 232; Metazoa - 1693; Fungi - 1; Plants - 543; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 441 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:1149475..1150455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37141.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 326 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSSSSVPAY LGDEDLTQET RALISSLPKE KGWLVSEIYE FQGLWHTQAI LQGILICQKR FEAKDSDIIL VTNPKSGTTW LKALVFALLN RHKFPVSSSG 101: NHPLLVTNPH LLVPFLEGVY YESPDFDFSS LPSPRLMNTH ISHLSLPESV KSSSCKIVYC CRNPKDMFVS LWHFGKKLAP EETADYPIEK AVEAFCEGKF 201: IGGPFWDHIL EYWYASRENP NKVLFVTYEE LKKQTEVEMK RIAEFLECGF IEEEEVREIV KLCSFESLSN LEVNKEGKLP NGIETKTFFR KGEIGGWRDT 301: LSESLAEEID RTIEEKFKGS GLKFSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)