AT5G63370.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT1G67580.2); Has 124008 Blast hits to 122212 proteins in 4207 species: Archae - 101; Bacteria - 14358; Metazoa - 46400; Fungi - 13041; Plants - 28799; Viruses - 480; Other Eukaryotes - 20829 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr5:-:25384954..25386792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 69623.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 612 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAGGVDVSR SSVAVKKDYD FYRNGSRDVY VRQSGRDDER RQIKRPSDHD LRRNDGRHRS RLAYEKGELR EEAEVQRPSE KRRKFSPIVW NAEKVGRAPS 101: REKTKSPFPV PTTTVISNQA VAGKTTSNDQ VNALMSPEPS YLAPVQPSEA LLAVKHPVDD LEEGQLEEEQ VMQEDVKEGL LEEEQVMQEP NIKTSRWGTG 201: LTSPKEELIS VNVSKTNRWN RSSLTPECEE VMVSEEQQCY SSGSGSGHLS VEKLSADGNS GREYYSSDHD ELEHEDQDSL TPGEMNMMFG SRSVNEFQKL 301: NKINEGTYGI VYKARDEKTK EIVALKKIKM KEDRFEEEYG FPLTSLREIN ILLSCNHPAI VNVKEVVVGG KNDNDVYMVM EHLEHDLRGV MDRRKEPFST 401: SEVKCLMMQL LDGLKYLHTN WIIHRDLKPS NLLMNNCGEL KICDFGMARQ YGSPIKPYTQ MVITQWYRPP ELLLGAKEYS TAVDMWSVGC IMAELLSQKP 501: LFPGKSELDQ LQKIFAVLGT PNEAIWPGFS SFPNAKAKFP TQPYNMLRKK FPAISFVGGQ ILSERGFDLL NSLLTLDPEK RLTVEDALNH GWFHEVPLPK 601: SKDFMPTYPP KR |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)