AT4G21940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Calcium Dependent Protein Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 15 (CPK15); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 21 (TAIR:AT4G04720.1); Has 133427 Blast hits to 125471 proteins in 4043 species: Archae - 134; Bacteria - 14075; Metazoa - 49650; Fungi - 18165; Plants - 27669; Viruses - 493; Other Eukaryotes - 23241 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:11640847..11643387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62578.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 554 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGCFSSKHRN TESDIINGSV QSSIPTNQPE NHVSRDVLKP QKPPSPQIPT TTQSNHHHQQ ESKPVNQQIE KKHVLTQPLK PIVFRETETI LGKPFEEIRK 101: LYTLGKELGR GQFGITYTCK ENSTGNTYAC KSILKRKLTR KQDIDDVKRE IQIMQYLSGQ ENIVEIKGAY EDRQSIHLVM ELCGGSELFD RIIAQGHYSE 201: KAAAGVIRSV LNVVQICHFM GVIHRDLKPE NFLLASTDEN AMLKATDFGL SVFIEEGKVY RDIVGSAYYV APEVLRRSYG KEIDIWSAGI ILYILLCGVP 301: PFWSETEKGI FNEIIKGEID FDSQPWPSIS ESAKDLVRKL LTKDPKQRIS AAQALEHPWI RGGEAPDKPI DSAVLSRMKQ FRAMNKLKKL ALKVIAESLS 401: EEEIKGLKTM FANMDTDKSG TITYEELKNG LAKLGSKLTE AEVKQLMEAA DVDGNGTIDY IEFISATMHR YRFDRDEHVF KAFQYFDKDN SGFITMDELE 501: SAMKEYGMGD EASIKEVIAE VDTDNDGRIN YEEFCAMMRS GITLPQQGKI LPVQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)