AT3G49290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ABL interactor-like protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of four ABI-like proteins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ABL interactor-like protein 2 (ABIL2); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ABL interactor-like protein 3 (TAIR:AT5G24310.1); Has 244 Blast hits to 235 proteins in 50 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 49; Fungi - 19; Plants - 157; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 16 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:18273407..18275221 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35779.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 312 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPASHEASNY DEVSMQQSML FSDGLQDLKN LRAQLYSAAE YFELSYTTDD KKQIVVETLK DYAVKALVNT VDHLGSVTYK VNDFIDEKVD EVSETELRVS 101: CIEQRLRMCQ EYMDHEGRSQ QSLVIDTPKF HKRYILPAGE IMTATNLEKL KYFGSSLEDA DDWNQFRNAV RATIRETPPP PVRKSTSQSS SPRQPPQRSA 201: TFSFTSTIPK KEQDKRSVSP HRFPLLRSGS VATRKSASIS RPTTPSKSRS ITPIRYPSEP RRSASVRVAF EKDNQKETEQ QQPSKSKRLL KALLSRRKTK 301: KDDTLYTFLD EY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)