AT2G45560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.746 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cytochrome P450 monooxygenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 1 (CYP76C1); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 4 (TAIR:AT2G45550.1); Has 35149 Blast hits to 34841 proteins in 1748 species: Archae - 60; Bacteria - 4538; Metazoa - 12163; Fungi - 7375; Plants - 9565; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 1442 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18776391..18778354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56803.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 512 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDIISGQALL LLFCFILSCF LIFTTTRSGR ISRGATALPP GPPRLPIIGN IHLVGKHPHR SFAELSKTYG PVMSLKLGSL NTVVIASPEA AREVLRTHDQ 101: ILSARSPTNA VRSINHQDAS LVWLPSSSAR WRLLRRLSVT QLLSPQRIEA TKALRMNKVK ELVSFISESS DREESVDISR VAFITTLNII SNILFSVDLG 201: SYNAKASING VQDTVISVMD AAGTPDAANY FPFLRFLDLQ GNVKTFKVCT ERLVRVFRGF IDAKIAEKSS QNNPKDVSKN DFVDNLLDYK GDESELSISD 301: IEHLLLDMFT AGTDTSSSTL EWAMTELLKN PKTMAKAQAE IDCVIGQNGI VEESDISKLP YLQAVVKETF RLHTPVPLLI PRKAESDAEI LGFMVLKDTQ 401: VLVNVWAIGR DPSVWDNPSQ FEPERFLGKD MDVRGRDYEL TPFGAGRRIC PGMPLAMKTV SLMLASLLYS FDWKLPKGVL SEDLDMDETF GLTLHKTNPL 501: HAVPVKKRAN IN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)