AT1G01910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; FUNCTIONS IN: ATP binding; INVOLVED IN: cellular metal ion homeostasis, anion transport; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, anion-transporting (InterPro:IPR003348); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein (TAIR:AT3G10350.1); Has 2854 Blast hits to 2413 proteins in 784 species: Archae - 172; Bacteria - 1905; Metazoa - 150; Fungi - 222; Plants - 105; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 300 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:313595..315831 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39672.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 353 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAADLPEATV QNILDQESLK WVFVGGKGGV GKTTCSSILA ICLASVRSSV LIISTDPAHN LSDAFQQRFT KSPTLVQGFS NLFAMEVDPT VETDDMAGTD 101: GMDGLFSDLA NAIPGIDEAM SFAEMLKLVQ TMDYATIVFD TAPTGHTLRL LQFPATLEKG LSKLMSLKSR FGGLMTQMSR MFGMEDEFGE DALLGRLEGL 201: KDVIEQVNRQ FKDPDMTTFV CVCIPEFLSL YETERLVQEL AKFEIDTHNI IINQVLYDDE DVESKLLRAR MRMQQKYLDQ FYMLYDDFNI TKLPLLPEEV 301: TGVEALKAFS HKFLTPYHPT TSRSNVEELE RKVHTLRLQL KTAEEELERV KSG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)