AT5G38990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Malectin/receptor-like protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Malectin/receptor-like protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Malectin/receptor-like protein kinase (InterPro:IPR021720), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Malectin/receptor-like protein kinase family protein (TAIR:AT5G39000.1); Has 116479 Blast hits to 115116 proteins in 4449 species: Archae - 93; Bacteria - 13074; Metazoa - 43265; Fungi - 9919; Plants - 32974; Viruses - 372; Other Eukaryotes - 16782 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:15608824..15611466 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 97958.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 880 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MICHVLVIFT ILVSAVVDAT ASYEPTDVFL INCGDTSNNM DYSGRNWTTE NPKFMSSNAV DDASFTSSAS YQESGIPQVP YLKARIFRYD FTYSFPVSPG 101: WKFLRLYFYP TRYGSDFDAV KSFFSVNVNR FTLLHNFSVK ASIPESSSLI KEFIVPVNQT LDLTFTPSPN SLAFVNGIEI ISMPDRFYSK GGFDDVVRNV 201: GRDVDFEIDN STAFETVYRV NVGGKVVGDV GDSGMFRRWL SDEGFLLGIN SGAIPNITGV KINYTDKTPA YVAPEDVYTT CRLMGNKDSP ELNLNFNLTW 301: LFEVDAGFAY IVRLHFCETQ PEVNKTGDRV FSIFFGYQLA MREMDVFRLS GGFRLPMYLD FKVLVDADGT SQRPSLRVDL TPYKEDYPTY YDAILSGVEI 401: LKLSNSDGNL AGLNPIPQLS PPPQSITPLK GKGKSSHVLP IIIAVVGSAV ALAFFVLVVV LVVMKRKKKS NESSVDTTNK PSTNSSWGPL LHGTGSTNTK 501: SASSLPSDLC RRFSIYEIKS ATNDFEEKLI IGVGGFGSVY KGRIDGGATL VAVKRLEITS NQGAKEFDTE LEMLSKLRHV HLVSLIGYCD DDNEMVLVYE 601: YMPHGTLKDH LFRRDKASDP PLSWKRRLEI CIGAARGLQY LHTGAKYTII HRDIKTTNIL LDENFVAKVS DFGLSRVGPT SASQTHVSTV VKGTFGYLDP 701: EYYRRQILTE KSDVYSFGVV LLEVLCCRPI RMQSVPPEQA DLIRWVKSNF NKRTVDQIID SDLTADITST SMEKFCEIAI RCVQDRGMER PPMNDVVWAL 801: EFALQLHETA KKKNDNVESL DLMPSGEVGT TTDGEDDLFS RTTGHVGKST TTDDSVLVVG DERSGSSWGV FSEINEPKAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)