AT1G65800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : receptor kinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a putative receptor-like serine/threonine protein kinases that is similar to brassica self-incompatibility (S) locus. expressed in specifically in cotyledons, leaves, and sepals, in correlation with the maturation of these structures. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
receptor kinase 2 (RK2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), Apple-like (InterPro:IPR003609), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), S-locus receptor kinase, C-terminal (InterPro:IPR021820), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), S-locus, receptor kinase (InterPro:IPR022126), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: receptor kinase 1 (TAIR:AT1G65790.1); Has 122202 Blast hits to 120473 proteins in 4562 species: Archae - 111; Bacteria - 13838; Metazoa - 44423; Fungi - 10348; Plants - 34995; Viruses - 424; Other Eukaryotes - 18063 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:24473166..24476523 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 95984.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 847 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRNVPNYHHS YFILFIIILF LAFSVYASNF SATESLTISS NKTIISPSQI FELGFFNPDS SSRWYLGIWY KIIPIRTYVW VANRDNPLSS SNGTLKISDN 101: NLVIFDQSDR PVWSTNITGG DVRSPVAAEL LDYGNFVLRD SKNNKPSGFL WQSFDFPTDT LLSDMKMGWD NKSGGFNRIL RSWKTTDDPS SGDFSTKLRT 201: SGFPEFYIYN KESITYRSGP WLGNRFSSVP GMKPVDYIDN SFTENNQQVV YSYRVNKTNI YSILSLSSTG LLQRLTWMEA AQSWKQLWYS PKDLCDNYKE 301: CGNYGYCDAN TSPICNCIKG FEPMNEQAAL RDDSVGCVRK TKLSCDGRDG FVRLKKMRLP DTTETSVDKG IGLKECEERC LKGCNCTAFA NTDIRNGGSG 401: CVIWSGGLFD IRNYAKGGQD LYVRVAAGDL EDKRIKSKKI IGSSIGVSIL LLLSFIIFHF WKRKQKRSIT IQTPIVDLVR SQDSLMNELV KASRSYTSKE 501: NKTDYLELPL MEWKALAMAT NNFSTDNKLG QGGFGIVYKG MLLDGKEIAV KRLSKMSSQG TDEFMNEVRL IAKLQHINLV RLLGCCVDKG EKMLIYEYLE 601: NLSLDSHLFD QTRSSNLNWQ KRFDIINGIA RGLLYLHQDS RCRIIHRDLK ASNVLLDKNM TPKISDFGMA RIFGREETEA NTRRVVGTYG YMSPEYAMDG 701: IFSMKSDVFS FGVLLLEIIS GKRNKGFYNS NRDLNLLGFV WRHWKEGKEL EIVDPINIDA LSSEFPTHEI LRCIQIGLLC VQERAEDRPV MSSVMVMLGS 801: ETTAIPQPKR PGFCVGRSSL EVDSSSSTQR DDECTVNQVT LSVIDAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)