AT4G28500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAC domain containing protein 73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NAC domain containing protein 73 (NAC073); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: No apical meristem (NAM) protein (InterPro:IPR003441); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAC domain containing protein 10 (TAIR:AT1G28470.1); Has 2322 Blast hits to 2317 proteins in 68 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 2321; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14083014..14084266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33698.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 305 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTWCNDRSDV QTVERIIPSP GAAESPVASL PVSCHKTCPS CGHNFKFHEQ AGIHDLPGLP AGVKFDPTDQ EVLEHLEGKV RDDAKKLHPL IDEFIRTIDG 101: ENGICYTHPE KLPGVNKDGT VRHFFHRPSK AYTTGTRKRR KVHTDSDVGG ETRWHKTGKT RPVLAGGRVR GYKKILVLYT NYGKQKKPEK TNWVMHQYHL 201: GTSEEEKEGE LVVSKVFYQT QPRQCGGSVA AAATAKDRPY LHGLGGGGGR HLHYHLHHNN GNGKSNGSGG TAGAGEYYHN IPAIISFNQT GIQNHLVHDS 301: QPFIP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)