AT4G14560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : indole-3-acetic acid inducible | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
auxin (indole-3-acetic acid) induced gene (IAA1) encoding a short-lived nuclear-localized transcriptional regulator protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
indole-3-acetic acid inducible (IAA1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aux/IAA-ARF-dimerisation (InterPro:IPR011525), AUX/IAA protein (InterPro:IPR003311); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: indole-3-acetic acid inducible 2 (TAIR:AT3G23030.1); Has 1898 Blast hits to 1895 proteins in 83 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 2; Plants - 1895; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:8361182..8361780 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19032.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 168 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEVTNGLNLK DTELRLGLPG AQEEQQLELS CVRSNNKRKN NDSTEESAPP PAKTQIVGWP PVRSNRKNNN NKNVSYVKVS MDGAPYLRKI DLKMYKNYPE 101: LLKALENMFK FTVGEYSERE GYKGSGFVPT YEDKDGDWML VGDVPWDMFS SSCQKLRIMK GSEAPTAL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)