AT4G08300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF6, transmembrane (InterPro:IPR000620); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein (TAIR:AT1G44800.1); Has 3616 Blast hits to 3605 proteins in 598 species: Archae - 32; Bacteria - 1860; Metazoa - 4; Fungi - 2; Plants - 1222; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 496 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:5245024..5248153 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40519.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 373 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKGGKMDKLK PIIAIISLQF GYAGMYIITM VSFKHGMNHW ILATYRHVVA TIVIAPFALI LERKIRPKMT WPLFLRILAL GFLEPLLDQN LYYIGMKATS 101: ATYSSAFVNA LPAITFIMAV IFRIETVNLK KTRSLAKVIG TAITVGGAMV MTLYKGPAIE LFKTAHSSLH GGSSGTSSET TDQNWVTGTL AVMGSITTWA 201: GFFILQSFTL KKYPAELSLV MWICAMGTVL NTIASLIMVR DVSAWKVGMD SGTLAAVYSG VVCSGMAYYI QSIVIRERGP VFTTSFSPMC MIITAFLGVL 301: VLAEKIHLGS IIGAIFIVFG LYSVVWGKAK DEVISVEEKI GMQELPITNT STKVEGGGIT SEVNEGVTNN TQV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)