AT3G53120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.929 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Modifier of rudimentary (Mod(r)) protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
VPS37-1; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Modifier of rudimentary, Modr (InterPro:IPR009851); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Modifier of rudimentary (Mod(r)) protein (TAIR:AT2G36680.1); Has 448 Blast hits to 448 proteins in 101 species: Archae - 0; Bacteria - 6; Metazoa - 285; Fungi - 19; Plants - 79; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 59 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19690729..19692490 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24941.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 217 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFNFWGSKDQ QQGQSRPQEA SSQSPWYSPS LVSSPSSSRP QSSGQISAQV SPGEAAGIIV FLKDKSVDEL RKLLSDKDAY QQFLLSLDQV KVQNNIKDEL 101: RRETLQLARD NLEKEPQIME LRNQCRIIRT TELATAQEKL NELERQKEEI LKFYSPGSLL HKLQEAMNQV DEESEALQEK FLEKEIDTAA FVQKYKKLRT 201: TYHRRALIHL AAKTSNI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)