AT3G14720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.651 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MAP kinase 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of MAP Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MAP kinase 19 (MPK19); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: mitogen-activated protein kinase 18 (TAIR:AT1G53510.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:4946057..4948906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67411.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 598 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQKTQEKKNM KEMEFFTEYG DANRYRILEV IGKGSYGVVC AAIDTQTGEK VAIKKINDVF EHVSDALRIL REVKLLRLLR HPDIVEIKSI MLPPSKREFK 101: DIYVVFELME SDLHQVIKAN DDLTREHHQF FLYQMLRALK YMHTANVYHR DLKPKNILAN ANCKLKVCDF GLARVSFNDT PTTVFWTDYV ATRWYRAPEL 201: CGSFCSKYTP AIDIWSIGCI FAEVLTGKPL FPGKSVVHQL DLITDLLGTP KSETIAGVRN EKARKYLNEM RKKNLVPFSQ KFPNADPLAL RLLQRLLAFD 301: PKDRPTAAEA LADPYFKCLA KVEREPSCQP ISKMEFEFER RRLTKDDIRE LIYREILEYH PQLLKDYMNS EGSSFLYPSA IGHLRKQFAY LEENSGKSGP 401: VIPPDRKHAS LPRSAVHSSA VNSNAQPSLN ASDSRRVSIE PSRNGVVPST SAYSTKPLGP PPRVPSGKPG RVVESSVTYE NDRNLKESSY DARTSYYRST 501: VLPPQTVSPN CYFLPNTMNQ EKRSGTEAAS QPKPQFVPTQ CNSAKPAELN PNPYVQSQHK VGIDAKLLHA QSQYGPAGAA AVAVAAHRNI GAVGYGMS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)