AT2G37560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : origin recognition complex second largest subunit 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Origin Recognition Complex subunit 2. Involved in the initiation of DNA replication. Regulated transcriptionally during cell cycle, peaking at G1/S-phase. Target of E2F/DF family of transcription factors. Interacts strongly with all ORC subunits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
origin recognition complex second largest subunit 2 (ORC2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Origin recognition complex, subunit 2 (InterPro:IPR007220); Has 366 Blast hits to 364 proteins in 185 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 129; Fungi - 134; Plants - 46; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 57 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15759568..15761116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40813.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 363 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEDIENIEED EYGFSRNYFL AKELGGASKR SAHKLSDIHI VDEQELRETA STIEMKHSKE ISELMSDYKT MYSKWVFELR CGFGLLMYGF GSKKALVEDF 101: ASASLTDYSV VVINGYLPSV NLKQVLLALA ELLSELLKCK RKSSGSLSKG QETFPSRSMD DILSFLHGPQ SGDKDCFICV VVHNIDGPAL RDPESQQTLA 201: RLSSCSHIRL VASIDHVNAP LLWDKKMVHK QFNWLWHHVP TFAPYNVEGV FFPLVLAQGS TAQTAKTAAI VLQSLTPNGQ NVFKILAEYQ LSHPDEDGMP 301: TDDLYSASRE RFFVSSQVTL NSHLTEFKDH ELVKTKRNSD GQECLNIPLT SDAIRQLLLD LNQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)