AT1G22070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : TGA1A-related gene 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a transcription factor. Like other TGAla-related factors, TGA3 has a highly conserved bZIP region and exhibits similar DNA-binding properties. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
TGA1A-related gene 3 (TGA3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor (InterPro:IPR004827), bZIP transcription factor, bZIP-1 (InterPro:IPR011616); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: bZIP transcription factor family protein (TAIR:AT1G77920.1); Has 1024 Blast hits to 1024 proteins in 132 species: Archae - 0; Bacteria - 78; Metazoa - 5; Fungi - 45; Plants - 790; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 106 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7789651..7791821 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43757.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 384 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEMMSSSSST TQVVSFRDMG MYEPFQQLSG WESPFKSDIN NITSNQNNNQ SSSTTLEVDA RPEADDNNRV NYTSVYNNSL EAEPSSNNDQ DEDRINDKMK 101: RRLAQNREAA RKSRLRKKAH VQQLEESRLK LSQLEQELVR ARQQGLCVRN SSDTSYLGPA GNMNSGIAAF EMEYTHWLEE QNRRVSEIRT ALQAHIGDIE 201: LKMLVDSCLN HYANLFRMKA DAAKADVFFL MSGMWRTSTE RFFQWIGGFR PSELLNVVMP YVEPLTDQQL LEVRNLQQSS QQAEEALSQG LDKLQQGLVE 301: SIAIQIKVVE SVNHGAPMAS AMENLQALES FVNQADHLRQ QTLQQMSKIL TTRQAARGLL ALGEYFHRLR ALSSLWAARP REHT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)